PLSCR1 представляет собой клетку

Блог

ДомДом / Блог / PLSCR1 представляет собой клетку

Aug 02, 2023

PLSCR1 представляет собой клетку

Nature, том 619, страницы 819–827 (2023 г.) Цитировать эту статью 15 тыс. Доступов 79 Подробности об альтернативных метриках Понимание защитного иммунитета к COVID-19 облегчает готовность к будущим пандемиям и

Nature, том 619, страницы 819–827 (2023 г.) Процитировать эту статью

15 тысяч доступов

79 Альтметрика

Подробности о метриках

Понимание защитного иммунитета к COVID-19 облегчает готовность к будущим пандемиям и борется с новыми вариантами SARS-CoV-2, появляющимися в человеческой популяции. Нейтрализующие антитела широко изучены; однако на основе крупномасштабного секвенирования экзома у защищенных и тяжелобольных пациентов с COVID-19 местная клеточно-автономная защита также имеет решающее значение1,2,3,4. Здесь мы идентифицируем фосфолипидную скрамблазу 1 (PLSCR1) как мощный клеточный автономный фактор рестрикции против живой инфекции SARS-CoV-2 в параллельных полногеномных скринингах CRISPR-Cas9 эпителия и гепатоцитов легких человека до и после стимуляции интерфероном-γ (IFNγ). ). PLSCR1, индуцированный IFNγ, не только ограничивал SARS-CoV-2 USA-WA1/2020, но также был эффективен против линий Delta B.1.617.2 и Omicron BA.1. Его сильная активность распространялась на другие высокопатогенные коронавирусы, была функционально консервативна у летучих мышей и мышей и препятствовала поглощению SARS-CoV-2 как по эндоцитарному, так и по TMPRSS2-зависимому пути слияния. Цельноклеточная наноскопия с переключением одной молекулы 4Pi вместе с анализом двудольных нанорепортеров показала, что PLSCR1 напрямую нацелен на везикулы, содержащие SARS-CoV-2, для предотвращения спайк-опосредованного слияния и выхода вируса. С-концевой β-бочкообразный домен PLSCR1, но не активность липидной скрамблазы, был важен для этой фузогенной блокады. Наши механистические исследования, а также сообщения о том, что мутации PLSCR1, связанные с COVID, обнаруживаются у некоторых восприимчивых людей3,4, идентифицируют антикоронавирусный белок, который вмешивается на поздней стадии проникновения, прежде чем вирусная РНК высвободится в цитозоль клетки-хозяина.

Клеточно-автономный иммунитет является важной стратегией выживания, используемой бактериями, растениями и животными для борьбы с инфекцией5,6,7. У людей он защищает слизистые барьеры и ткани-мишени от основных тропных для человека патогенов, включая микобактерию туберкулеза, серовар Salmonella enterica Typhi, Shigella flexneri и ВИЧ-18,9,10,11. Однако вопрос о том, борется ли клеточно-автономный иммунитет с SARS-CoV-2, до конца не исследован, поскольку основное внимание сосредоточено на роли нейтрализующих антител. Этот вопрос становится еще более актуальным, учитывая данные, показывающие, что Т-клетки распознают вакцины против SARS-CoV-2 и новые вызывающие беспокойство варианты вируса (ЛОС) путем секреции IFNγ12,13, цитокина типа II, который, как известно, мобилизует клеточный автономный иммунитет человека в большинстве случаев. ядросодержащие клетки5. Действительно, повышенное производство IFNγ совпадает с защитой от COVID-19 у молодых людей и детей, а также с увеличением экспрессии интерферонов типа I (IFNα и IFNβ) и III (IFNλ) (IFN)14,15. Соответственно, генетические нарушения в передаче сигналов ИФН часто связаны с тяжелым заболеванием1,2,3,4,16, что вместе с аутоантителами к ИФН типа I и II17,18,19 может составлять до 20% критических случаев COVID-1920. Кроме того, терапия IFNγ способствовала клиренсу SARS-CoV-2 и спасла пациентов с иммунодефицитом с COVID-19, которые не выздоровели после лечения реконвалесцентной плазмой или ремдесивиром21. В совокупности эти открытия позволяют предположить, что IFNγ может действовать как центральный организатор защиты от SARS-CoV-2. Характеристика его активности даст представление о том, как клеточно-автономный иммунитет обеспечивает передовую устойчивость во время COVID-19, и поможет нам понять как естественную, так и вакцино-индуцированную защиту.

Сначала мы проверили эффективность IFNγ в ограничении заражения живым SARS-CoV-2, используя клетки гепатомы человека Huh7.5, которые естественным образом экспрессируют рецептор ACE222,23,24. SARS-CoV-2 USA-WA1/2020 оказался высокочувствительным к рекомбинантному человеческому IFNγ; средняя ингибирующая концентрация на половине максимума (IC50) 7,14 пМ напоминала таковую у рекомбинантного человеческого IFNα2a (IC50, 3,25 пМ) на кривых зависимости реакции от дозы (рис. 1а). Мощная активность IFNγ против SARS-CoV-2 была подтверждена с использованием технологии CRISPR-Cas9 для удаления преобразователя сигнала и активатора транскрипции-1 (STAT1), который необходим для экспрессии генов, индуцированной IFNγ. Стабильные клетки Huh7.5 с нокаутом STAT1 (KO) не смогли контролировать SARS-CoV-2 после воздействия рекомбинантного человеческого IFNγ (рис. 1b). Таким образом, человеческий IFNγ типа II является мощным сигналом, перепрограммирующим клетки человека для ограничения SARS-CoV-2 STAT1-зависимым образом.

 10) were counted to ENCODE gene annotation (v.24) using FeatureCounts. Differential gene expression was analysed with the R package DESeq2. Transcripts with a log2-transformed fold change > 1 and adjusted P < 0.05 were considered as differentially expressed./p>

3.0.CO;2-H" data-track-action="article reference" href="https://doi.org/10.1002%2F%28SICI%291096-987X%28199709%2918%3A12%3C1463%3A%3AAID-JCC4%3E3.0.CO%3B2-H" aria-label="Article reference 66" data-doi="10.1002/(SICI)1096-987X(199709)18:123.0.CO;2-H"Article CAS Google Scholar /p> 1 and adjusted P value < 0.05 are presented on the plot. Several upregulated ISGs with known antiviral activities were highlighted. d, Western blot showing the IFNγ-induced upregulation of PLSCR1 across cell lines. hTEC: human primary tracheal epithelial cells. e, Western blot showing the protein expression of PLSCR1 in cells treated with the indicated cytokines for 20 h. Concentrations used: IFNα2a/β1a (500 U ml−1), IFNγ (500 U ml−1), IFNλ1 (1 ng ml−1), TNF (100 ng ml−1), IL1β (25 ng ml−1). f, Schema depicting the presence and position of GAS and ISRE elements in the promoter region (2 kb upstream from the transcription initiation site) of human PLSCR1 gene. g, Effect of PLSCR1 deficiency on IFNα2a (n = 3), IFNβ1a (n = 4) or IFN λ1 (n = 4) mediated restriction of SARS-CoV-2-mNG infection in Huh7.5 cells (MOI = 1, 48 hpi). Concentrations used: IFNα2a (50 U ml−1), IFNβ1a (2,000 U ml−1) and IFNλ1 (1 ng ml−1). Data are mean ± s.d. P values were calculated using one-way ANOVA followed by Tukey’s multiple comparison test (b) or two-way ANOVA, followed by Tukey’s test (g). Scale bar in a: 500 μm. Experiments in this figure were performed three times./p>

1 and adjusted P value < 0.05 are highlighted in red. (n = 3). c, Sequence homology alignment of sequences flanking the H262 residue in PLSCR1 orthologues. d, Left, quantification of SARS-CoV-2 infection in NC or PLSCR1-KO Huh7.5 cells expressing the indicated mutants of human, mouse or bat PLSCR1. (MOI = 1, 48 hpi). Right, western blot showing the protein expression. (n = 6). e, Left, quantification of SARS-CoV-2 infection in NC or PLSCR1-KO Huh7.5 cells expressing the indicated single-point substitutions of the H262 residue. (MOI = 1, 48 hpi). Right, western blot showing the protein expression. (n = 6). Data are mean ± s.d. P values were calculated using one-way ANOVA followed by Tukey’s multiple comparison test in a,d,e or DESeq2 algorithm in b. Experiments in this figure were performed three times./p>